故事的舞臺是互聯(lián)網(wǎng)系統(tǒng)發(fā)達(dá)的都市「DEN CITY」在那里有經(jīng)由巨型企業(yè)「SOL技術(shù)社」通過高度的網(wǎng)絡(luò)技術(shù)構(gòu)筑而成的被稱為「LINK VRAINS」的VR空間人們都在那個VR空間中為體驗到全新的決斗而狂熱可是在「LINK VRAINS」中卻出現(xiàn)了利用決斗來進(jìn)行黑客行為的謎之黑客集團(tuán)「海諾因騎士團(tuán)」而他們的目標(biāo)是將存在于互聯(lián)網(wǎng)的某處的“AI們的世界=電子界”毀滅然而在世界受到這樣的威脅時有一名決斗者站了出來而他的名字正是「Playmaker」在那場傳奇的戰(zhàn)斗中「Playmaker」使用壓倒性的決斗將「海諾因騎士團(tuán)」打倒成功捕獲了「SOL技術(shù)社」和「海諾因騎士團(tuán)」都想要得手的迷之AI程序一度拯救了世界然后卻突然消聲匿跡了而他的名字就在互聯(lián)網(wǎng)的世界中一瞬間變得聲名遠(yuǎn)播成為了傳說而現(xiàn)在作為「Playmaker」的正體的某位高中生藤木游作為了尋找過去發(fā)生的某件事件的真相對再次在「VRAINS」出現(xiàn)的「海諾因騎士團(tuán)」展開了追擊...... 以此為契機(jī)命運的齒輪就此轉(zhuǎn)動……迷之AI的真身「海諾因騎士團(tuán)」盯上「Link Vrains」的目的以及隱藏在游作過去的真相到底是———所有的答案都在「Link Vrains」中